למחלקת פטנטים של הרשות מוגשות בקשות לפטנטים מכל העולם. כל בקשה מופנית לפי תחום האמצאה לבחינה על ידי בוחן שהוא מהנדס או אקדמאי המתמחה באותו תחום, ואם היא עונה על דרישות החוק, היא תזכה למתן פטנט. רשם הפטנטים, באמצעות פקידי הרשות והבוחנים, מופקד על מתן פטנטים ועל ניהול פנקס הפטנטים. שאר תפקידי רשם הפטנטים, בוחני הפטנטים ופקידי הרשות ודרכי עבודתם מוגדרים בחוק הפטנטים, התשכ"ז-1967, ובתקנות הפטנטים.